埃博拉病毒——从文献计量角度展示其研究现状

July 31, 2014

埃博拉病毒是迄今发现的致死率最高的病毒之一,尚无有效疗法。其特征包括突发性发烧、极度虚弱、肌肉疼痛、头痛和咽喉痛。

以上这段文字摘自腾讯的昨天的新闻,标题为[中国首现埃博拉病毒疑似病例 被隔离治疗]。可能大家已经对各种病毒的致死性麻木了,艾滋、非典、禽流感、炭疽等,我们什么没经历过?所以,这个新闻也就淹没在了习总的户籍改革和周老虎被打下山的消息中了。

科学网上在我写作这篇博文的时候,刚刚有人发布了博文,主要从生物学医学角度介绍了埃博拉病毒的历史、来源、特征、传播途径以及疫情现状。如果大家想深入了解埃博拉病毒,可以点阅该博文,或者去维基百科看看。接下来,我就从文献计量学的角度,展示一下国际对埃博拉病毒的研究现状。(图皆为原创,如需转载使用,请留言)

仅有2000多篇文献

在Web of Science Core Collection(TR)数据库中以“ebola”为关键词在Title/Keywords/Abstract中搜索,一共得到了2211篇文献题录,这是相当小的数字了,要知道,当我把关键词换成AIDS的时候,可以找到146442篇文献题录,与其他媒体上常见的流行病毒研究数量的比较见图1。

fig.1 viruses comparison

可见,和其他已经很可怕的病毒相比,与埃博拉病毒相关的研究数量是少之又少,甚至只占图中排在倒数第二的炭疽病毒的三分之一。但,艾滋病毒的研究数量相较之下如此之多,也有些出乎意料。

每年都在增长?

fig.2 yearly trend of publication numbers

fig.3 yearly trend of publication shares to all literature

从时间序列角度来看,我做了图2和图3,分别是埃博拉病毒相关研究的文献数量的年度变化,和这些文献每年占所有学科在Web of Science Core Collection数据库中出现的文献数量的百分比,这样做是为了排除由于科技发展、科研人员数量的增加带来的研究数量增长等因素。

从图2可以看出,相关研究最早出现在1977年,而人类首次发现埃博拉病毒是在1976年,这很合理,因为针对病毒性的科学研究是有滞后性的。我还可以验证这一结论,即在埃博拉病毒的维基百科页面上透露了:

薩伊伊波拉病毒有高達90%的致死率,在流行地區死亡率1976年為88%、1977年為100%、1994年為59%、1995年為81%、1996年為73%、2001年至2002年為80%,2003年則是90%,2007年平均為83%。

我推测或者假设,这是人类有记载的埃博拉病毒的几次大爆发大流行。可见,1976、77年的两次爆发,开拓了对埃博拉病毒的研究先河,之后的十几年间并未发生更严重的疫情,直到1994至1996年,连续发生了三年疫情,死亡率平均在60%左右,在图2中的反应就是从1995年开始的研究数量较之前至少翻了一番之多,引起了国际的广泛重视。到了2001至2003年间,又连续三年爆发疫情,死亡率飙到了80%以上,而相关研究数量则在2003年才开始有了较大增长,也是滞后了至少一年。同样道理适用于2007年的那次疫情,相关研究数量在2011年有了显著增长。

以上猜测都是描述性的。只证明了针对致命性病毒的研究是滞后的这个结论。下面,我们要关注一下,到底从时间尺度上看,埃博拉相关的研究数量有没有真正增长。从图1来看,单纯的数量是有显著性增长的,例如2000年至2013年(Mann-Kendall, tau = 0.729, p < 0.001),而图2中,这一时间段就没有显著性增长(Mann-Kendall, tau = 0.385, p = 0.063)。也就是说,近十来年,国际上对埃博拉病毒的研究数量是处于停滞不前的状态。我猜,这不是什么好消息。

国际合作研究?

好吧,我们换个角度。我从每篇文献的affiliation中提取出国家名,做出以下假设:如在同一篇文献中出现两个或两个以上国家名,则认定该文献为国际间的合作研究。好了,下图是按照国家出现频率从高到低排名的前30个国家的埃博拉相关研究总数及其占全球总研究数的百分比,以及本国独立研究和国际合作研究的数量及相对百分比。

fig.4 ebola country table

可见,美国一家占了一半以上,亚洲的日本排在第6,中国排在第11,非洲的加蓬排在第9,除此之外出现的非洲国家还有南非(15)、乌干达(16)、肯尼亚(26)、赞比亚(29)、喀麦隆(30)。从国际合作研究所占比例来看,除美国、俄罗斯、中国之外,其他国家都是国际合作数量要多于本国独立研究的数量。加蓬一共有55篇文献,其中只有1篇是其本国独立研究完成的。那么,究竟他们是和哪些国家合作完成的呢?

fig.5 country cooperation network

图5表示的是这30个国家间的合作关系网状图,其中每个节点的大小表示其研究总数的大小,连线的粗细度表示的是两个国家间的合作关系紧密程度。因此,我们可以看出,加蓬和法国的合作是最为紧密的,而美国和前6名的国家合作都很紧密,大部分国家和美国的合作也是相对很频繁的。

此外,前30的国家中有五分之一的来自非洲,这也是我做文献计量分析以来,非洲国家所占比最高的一次,这肯定和大部分疫情都发生在非洲有关,尤其是西非。

关键词热点?

我还做了基于作者设置的文献关键词的相关处理(包括关键词热度趋势分析等),由于不是我的专业,我无法做出任何有价值的现状描述和分析。就放上来一张图如下,是前20个出现频率最高的关键词词根的关系网状图。

fig.6 top 20 keywords network

我们该怎么办?

我觉得,除了避免去非洲尤其是西非旅游,是我们普通人唯一能做的事情了。另外,推荐大家阅读[埃博拉病毒有多致命],是记者跟美国的一位微生物免疫学教授的问答,算是权威解答了。希望可以缓解大家的紧张。

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